Het eerste orgel uit 1541 is verloren gegaan bij de brand van 1699. In 1778 besloten twee Heukelumse regenten, Simon van der Stel en “Regeerent Gasthuismeester” Frans C. de Groot dat de gemeentezang weer ondersteund zou worden door een orgel. De wapens van beide heren sieren het orgel ter linker- en rechterzijde.
 

Bij Gideon Bâtz, zoon van een befaamde orgelbouwer, werd een orgel besteld. Bâtz bouwde een orgel dat geschikt was om een “luid zingende” gemeente te begeleiden. Met onder andere samengestelde registers als mixtuur en cornet. De trompet is het enige register dat niet meer origineel is. Dit register is bij de laatste restauratie in 1969 vervangen. In 2015 heeft de laatste restauratie plaatsgevonden.Het ruim tweehonderd jaar oude instrument is toen opgeknapt door de firma Elbertse uit Soest. De restauratie duurde langer dan verwacht, omdat er tijdens het werk een paar verborgen gebreken boven water kwamen. Zo zijn er voor de trompet, die voor de restauratie nooit optimaal heeft gefunctioneerd, handmatig nieuwe onderdelen (voor de kenners: “kelen, tongen en stemkrukken”) gemaakt.